Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms