Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms