Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC6Q9UBN7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC6Q9UBN7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms