Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms