Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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