Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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