Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms