Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM7SF3Q9NS93 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms