Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TULP4Q9NRJ4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms