Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BATF3Q9NR55 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms