Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SDCBP2Q9H190 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SDCBP2Q9H190 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms