Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COMMD5Q9GZQ3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms