Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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FOXQ1Q9C009 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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FOXQ1Q9C009 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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FOXQ1Q9C009 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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