Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EDEM3Q9BZQ6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms