Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUS3Q9BZE2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms