Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A5Q9BY07 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms