Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLVAPQ9BX97 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms