Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PI4K2AQ9BTU6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PI4K2AQ9BTU6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms