Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms