Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MEIS3Q99687 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms