Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL13Q99616 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms