Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPS6KC1Q96S38 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS6KC1Q96S38 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms