Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCNAQ96QF7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms