Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP53Q96M91 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms