Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227BQ96M60 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms