Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms