Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms