Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTV1Q96GA3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms