Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDC3Q96F86 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms