Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EME1Q96AY2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms