Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 BGN-204ENST00000480756 2278 ntTSL 513.94□□□□□ -0.184e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 GNL1-202ENST00000433809 1093 ntTSL 213.92□□□□□ -0.184e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.184e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.194e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UROD-219ENST00000494399 1848 ntTSL 213.85□□□□□ -0.194e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.24e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.214e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UROD-218ENST00000491773 676 ntTSL 213.75□□□□□ -0.214e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 BDP1-204ENST00000508917 7194 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UROD-205ENST00000460906 820 ntTSL 513.67□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 C3orf33-203ENST00000482061 1926 ntTSL 213.62□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CORO1B-209ENST00000616321 4464 ntTSL 213.6□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RDH13-201ENST00000291892 3022 ntTSL 213.47□□□□□ -0.254e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.254e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 BRD2-219ENST00000607833 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.274e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RDH13-219ENST00000591960 1328 ntTSL 513.32□□□□□ -0.284e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.284e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.284e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 APMAP-202ENST00000451442 2117 ntTSL 513.22□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.34e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.34e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.314e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 C12orf65-203ENST00000425637 1632 ntTSL 213.09□□□□□ -0.314e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.324e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RHOH-223ENST00000619474 2230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RHOH-221ENST00000615577 2227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 ZNF652-203ENST00000508237 4543 ntTSL 212.94□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CRYL1-203ENST00000480748 1035 ntTSL 312.91□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.364e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.364e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 C12orf65-207ENST00000543139 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.79□□□□□ -0.364e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.364e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CASZ1-201ENST00000344008 4405 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UROD-214ENST00000478467 857 ntTSL 312.71□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.384e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RALB-205ENST00000447591 558 ntTSL 412.67□□□□□ -0.384e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 FYN-206ENST00000462598 825 ntTSL 512.63□□□□□ -0.394e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.394e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SGSM2-203ENST00000570431 392 ntTSL 312.58□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 BGN-203ENST00000472615 2225 ntTSL 512.58□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 ATAD3B-203ENST00000472194 4314 ntTSL 1 (best)12.57□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.49e-27■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 HSPA8-222ENST00000534319 1884 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.414e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.424e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 BGN-201ENST00000331595 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.424e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CXXC5-213ENST00000511591 442 ntTSL 312.37□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.444e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RAD51D-202ENST00000345365 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.454e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 STK36-209ENST00000462031 582 ntTSL 212.27□□□□□ -0.454e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 WDR62-201ENST00000270301 4632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.454e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 C3orf33-204ENST00000486435 864 ntTSL 512.24□□□□□ -0.454e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.454e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 C3orf33-202ENST00000465810 733 ntTSL 512.2□□□□□ -0.464e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UROD-207ENST00000462688 901 ntTSL 512.15□□□□□ -0.464e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UROD-213ENST00000473012 632 ntTSL 312.13□□□□□ -0.474e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 OGFOD3-207ENST00000579407 759 ntTSL 212.12□□□□□ -0.474e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.474e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 FYN-203ENST00000368667 2416 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.474e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.474e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 HSPA8-201ENST00000227378 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.494e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 AC008537.1-201ENST00000601627 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 GAS7-201ENST00000323816 8033 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 GAS7-204ENST00000437099 8003 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 BRD2-204ENST00000449025 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 BRD2-205ENST00000449085 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 HDAC3-204ENST00000469207 829 ntTSL 311.81□□□□□ -0.524e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 HSPA8-207ENST00000526110 1924 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.524e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 FYN-201ENST00000229471 2009 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.524e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UBTF-211ENST00000530828 721 ntTSL 511.76□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 IPO13-202ENST00000372343 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.544e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 STK36-207ENST00000440309 4721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.554e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RAB15-204ENST00000554593 533 ntTSL 411.4□□□□□ -0.584e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 GFM1-201ENST00000264263 3453 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.584e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNPY2-209ENST00000551475 674 ntTSL 511.37□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SLC9A8-202ENST00000417961 6309 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SGSM2-211ENST00000574563 3410 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 USP7-215ENST00000566273 577 ntTSL 411.33□□□□□ -0.64e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 GAS7-208ENST00000578655 603 ntTSL 411.32□□□□□ -0.64e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UROD-215ENST00000486699 968 ntTSL 311.32□□□□□ -0.64e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 GFM1-207ENST00000478254 3470 ntTSL 511.3□□□□□ -0.64e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 LINC00469-201ENST00000321800 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.614e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UROD-211ENST00000469548 1044 ntTSL 211.24□□□□□ -0.614e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 OCIAD1-205ENST00000444354 1756 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.614e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 KCNJ10-202ENST00000509700 870 ntTSL 511.19□□□□□ -0.624e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 NUMB-212ENST00000554546 3607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.624e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CASZ1-209ENST00000496432 3279 ntTSL 211.17□□□□□ -0.624e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UROD-221ENST00000636293 1102 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UROD-203ENST00000434478 600 ntTSL 311.13□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 UROD-222ENST00000636836 1173 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 INPP5D-202ENST00000415617 3628 ntTSL 511.11□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 HSPA8-215ENST00000532091 2301 ntTSL 511.07□□□□□ -0.644e-6■■■■■ 48.1
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 264.5 ms