Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms