Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRF1Q92994 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms