Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSH3Q8TE77 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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