Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms