Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms