Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms