Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms