Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP1Q86WV1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms