Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXNDC2Q86VQ3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXNDC2Q86VQ3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms