Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms