Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC73Q6ZRK6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC73Q6ZRK6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms