Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VITQ6UXI7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VITQ6UXI7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms