Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OPN5Q6U736 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OPN5Q6U736 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OPN5Q6U736 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OPN5Q6U736 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms