Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L2Q6R6M4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms