Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTR9Q6PD62 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms