Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KANK3Q6NY19 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms