Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDF6Q6KF10 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GDF6Q6KF10 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms