Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ABLIM2Q6H8Q1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ABLIM2Q6H8Q1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms