Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms